Chemtool mengandalkan transfig oleh Brian Smith untuk mencetak postscript dan mengekspor file dalam format PicTeX dan EPS. Program pendampingnya, XFig, direkomendasikan untuk meningkatkan keluaran chemtool, dan untuk pembuatan diagram dan skema 2D secara umum. Keduanya disertakan dengan sebagian besar distribusi Linux, dan tersedia melalui sejumlah situs web termasuk www.xfig.org. Jika Anda ingin mengimpor gambar chemtool ke dalam program pengolah kata selain LaTeX, Anda mungkin ingin menambahkan bitmap pratinjau ke dalamnya, karena baik StarOffice/OpenOffice maupun perangkat lunak dari Redmond tampaknya tidak dapat menampilkan sisipan postscript di layar tanpa sisipan tersebut. Untuk tujuan ini, gunakan ps2epsi yang disertakan skrip hantu, atau epstool, bagian dari tampilan gs direkomendasikan. Sejak chemtool-1.6, opsi ini didukung secara langsung (melalui fungsi setara yang ditawarkan oleh transfig versi terbaru).

Chemtool awalnya ditulis oleh Thomas Volk, yang saat itu menjadi mahasiswa kimia dan biologi di universitas Ulm, Jerman. Versinya, yang dijelaskan dalam an artikel di majalah LinuxMagazin berkala Jerman, menggunakan X11 biasa.

Saya terlibat dalam pengembangan segera setelah membaca artikel ini, menambahkan beberapa jenis ikatan dan semacamnya, dan secara bertahap mengambil alih darinya karena dia kekurangan waktu karena ujiannya semakin dekat, dan mungkin secara umum beralih ke hal lain. Perhatikan bahwa saya tidak melakukan ini sendirian – sebagian besar kemajuan disebabkan oleh kontribusi kode, terjemahan, contoh, atau sekadar ide.