Atomix er et puslespill hvor du flytter atomer for å bygge et molekyl.

Du starter spillet med kartet fylt med vegger og noen få atomer, som du kan flytte i alle retninger. Imidlertid vil atomene ikke stoppe før de treffer en vegg eller et annet atom. Du kan se en forhåndsvisning av hvilket molekyl du må bygge, og du må gjøre ditt beste for å finne hvor du skal bygge molekylet, og flytte atomene dit.