Chemtool s'appuie sur transfig de Brian Smith pour l'impression postscript et l'exportation de fichiers aux formats PicTeX et EPS. Son programme compagnon, XFig, est recommandé pour améliorer les résultats de chemtool et pour la création de diagrammes et de schémas 2D en général. Les deux sont inclus avec la plupart des distributions de Linux et sont disponibles sur un certain nombre de sites Web, notamment www.xfig.org. Si vous souhaitez importer des dessins chemtool dans des programmes de traitement de texte autres que LaTeX, vous souhaiterez probablement y ajouter un bitmap d'aperçu, car ni StarOffice/OpenOffice ni ce logiciel de Redmond ne semblent pouvoir afficher les insertions postscript à l'écran sans eux. À cette fin, en utilisant soit ps2epsi, fourni avec script fantôme, ou epstool, une partie de vue gs est recommandé. Depuis chemtool-1.6, cette option est supportée directement (via la fonction équivalente proposée par les versions récentes de transfig).

Chemtool a été initialement écrit par Thomas Volk, alors étudiant en chimie et biologie à l'université d'Ulm, en Allemagne. Sa version, décrite dans un article dans le périodique allemand LinuxMagazin, utilisait plain X11.

Je me suis impliqué dans le développement peu de temps après avoir lu cet article, en ajoutant quelques types de liens et autres, et je l'ai progressivement remplacé car il manquait de temps en raison de l'approche de ses examens, et je suis probablement passé généralement à autre chose. Notez que je ne le fais pas seul – une grande partie des progrès est due à des contributions de code, de traductions, d’exemples ou simplement d’idées.