Chemtool разчита на transfig от Brian Smith за постскрипт печат и експортиране на файлове във формати PicTeX и EPS. Неговата придружаваща програма, XFig, се препоръчва за подобряване на резултатите от chemtool и за създаване на 2D диаграми и схеми като цяло. И двете са включени в повечето дистрибуции на Linux и са достъпни чрез редица уебсайтове, включително www.xfig.org. Ако искате да импортирате чертежи на chemtool в програми за текстообработка, различни от LaTeX, вероятно ще искате да добавите растерна графика за предварителен преглед към тях, тъй като нито StarOffice/OpenOffice, нито този софтуер от Redmond изглежда могат да показват постскрипт вмъквания на екрана без тях. За тази цел, използвайки или ps2epsi, който идва с ghostscript, или epstool, част от gsview се препоръчва. От chemtool-1.6 тази опция се поддържа директно (чрез еквивалентната функция, предлагана от последните версии на transfig).

Първоначално Chemtool е написан от Томас Волк, тогава студент по химия и биология в университета в Улм, Германия. Неговата версия, описана в ан статия в немския периодичен журнал LinuxMagazin, използваше обикновен X11.

Започнах да се занимавам с разработка малко след като прочетох тази статия, добавяйки няколко вида облигации и други подобни, и постепенно поех управлението от него, тъй като му липсваше време поради наближаването на изпитите му и вероятно като цяло преминавах към други неща. Обърнете внимание, че не правя това сам – голяма част от напредъка се дължи на принос на код, преводи, примери или просто идеи.